Sekolah Tinggi Teologi Nusantara disingkat dengan STTN adalah sebuah Institusi yang berada dibawa naungan Yayasan PINTA. pada tahun 1990, lembaga pendidikan ini dipindahkan ke kota Salatiga, Jawa Tengah. Kemudian pada tahun 1994 menjadi Akademi Theologia Salatiga (ATS) atas petunjuk Direktoral Jenderal Bimbingan Masyarakat Kristen (protestan) Departemen Agama RI.

     Pada tahun 1996, diizinkan untuk meningkatkan program pendidikan dari Diploma menjadi Strata Satu (S-1) dengan perubahan nama mejadi Sekolah tinggi teologi Nusantara (STTN).

     Beberapa tahun kemudian, dimana perkembanganyang intensif terjadi, sehingga mulai dibangunnya kompleks pendidikan dan asrama yang , permanen dan memadai di Jl. Raya Kopeng KM. 03, Desa Bendosari, Salatiga, Jawa Tengah. Kemudian beberapa dosen baru yang berkualitas dan berpengalaman  telah dan sedang rekrut, dan jumlah mahasiswa dari berbagai daerah di Indonesia semakin bertambah. 

     Segala puji dan syukur atas rahmat Tuhan Yesus kristus, Sekolah Tinggi Teologi Nusantara masih tetap berdiri hingga saat ini.